Alors que la dernière épreuve de l'examen pour intégrer les Forces de Défense s'achève, un mystérieux kaiju humanoi[u0308]de fait son apparition et ressuscite le monstre principal que Kikoru venait d'abattre. Pour la sauver, Kafka n'a pas d'autre choix que de se transformer devant elle, lui dévoilant son secret ! Cette intervention ne fait qu'attiser les soupçons du vice-commandant Hoshina sur sa nouvelle recrue... C'est alors qu'une alerte kaiju résonne : un honju colossal, entouré d'une myriade de yoju, a surgi dans la banlieue de Tokyo !